ועדת השרים לענייני חקיקה דחתה, כנגד דעתו החולקת של השר מיכאל איתן, את הצעתו של פרופ' עדי שמיר להקים את המאגר הביומטרי באופן שיאפשר זיהוי אדם אך יקשה על שיוך המידע הביומטרי לאדם מסוים. פרופ' שמיר, חתן פרס ישראל במדעי המחשב לשנת 2008, הוא קריפטולוג בעל שם עולמי, שבין השאר נטל חלק בפיתוח אלגוריתם ההצפנה הידוע RSA, שהיה הראשון לאפשר העברת מסרים מוצפנים בין שני גורמים שלא תיאמו ביניהם מראש מפתח הצפנה (שיטה הידועה כהצפנה א-סימטרית או הצפנה במפתח כפול).

לפי הצעת שמיר, המאגר הביומטרי יופרד לקבוצות, וקשה לאתר את הקשר בין הנתון הביומטרי (טביעת אצבע, נתוני זיהוי פנים) ובין בעליו. כך, אם ייפרץ המאגר, לא יוכל הפורץ לדעת למי שייכים הנתונים שהשיג. התוכנית זכתה לתמיכת הרשות למשפט, מידע וטכנולוגיה, הממונה על ההגנה על הפרטיות בישראל (ו- law.co.il מוצא אפוא שההחלטה מהווה מכה למעמדה). שר הפנים אלי ישי, שר האוצר יובל שטייניץ ושר המשפטים יעקב נאמן תמכו בתקנות ובמבנה המאגר המתוכנן, והורידו את הצעת הפרופ' שמיר מן הפרק. למולם ניצב רק איתן, השר הממונה על שיפור שירותי הממשלה לציבור – והתנגד בתוקף. מקור: Ynet.