המשטרה השתמשה בתוכנת הריגול פגסוס של NSO בהיקף רחב לאין שיעור מכפי שהיה ידוע עד כה - פוליטיקאים, אנשי עסקים בכירים, מנכ"לי משרדים ממשלתיים, ראשי ערים, מנהלי חברות ענק, עיתונאים, מארגני מחאות מכל סוג ומין כמעט, יועצי ראש הממשלה ובני משפחתו - כולם היו יעד לתוכנה שהוחדרה בחשאי לטלפונים הסלולריים שלהם ואיפשרה שליטה מלאה בהם. כך חושף המשך התחקיר של תומר גנון בעיתון כלכליסט, המתפרסם הבוקר.
לדברי התחקיר, אנשי צוות המ"מ (מבצעים מיוחדים) בחטיבת הסייבר־סיגינט המשטרתית חודרים במשך שנים באופן סמוי באמצעות פגסוס ("סייפן" בעגה המשטרתית) לטלפונים של אזרחים ומשתלטים עליהם בלי היתר בחוק לעשות זאת ובלי צו מבית משפט, מתוך הבנה ששופטים לא יאשרו התנהלות כזאת.
בין האישים שכך פעלו נגדם - מנכ"לי משרד האוצר לשעבר, קרן טרנר איל ושי באב"ד (בחשד שהדליפו מידע לעתונאים), אמי פלמור, לשעבר מנכ"לית משרד המשפטים (לא ברור מדוע), איש העסקים רמי לוי שנחשד במתן שוחד לראש המועצה המקומית מבשרת ציון (החקירה הסתיימה בלא ממצאים), יאיר כ"ץ, יו"ר ועד העובדים בתעשיה האווירית, אילן ישועה (לשעבר מנכ"ל וואלה), סטלה הנדלר (לשעבר מנכ"לית בזק), דוד מזרחי (כיום מנכ"ל בזק), אבי ברגר (לשעבר מנכ"ל משרד התקשורת), אבנר נתניהו (בנו של ראש הממשלה לשעבר), טופז לוק ויונתן אוריך (יועצי נתניהו), איריס אלוביץ' (אשתו של בעל השליטה בבזק, שאול אלוביץ, הנאשמת איתו בתיק 4000) ועד המדינה בתיק שלמה פילבר (לשעבר מנכ"ל משרד התקשורת). עוד הודבקו ברוגלה ראשי ערים ומועצות מקומיות ועתונאים.
לדברי התחקיר, השימוש בפגסוס נעשה תחת המפכ"ל וסגן ראש השב"כ לשעבר רוני אלשייך. ראש חטיבת הסיגינט במשטרה היה תת־ניצב יואב חסן וראש מחלקת טכנולוגיות, יוסף כחלון, שהגיעו למשטרה מ- 8200. בפגסוס הודבקו מפגינים וראשי מחאה כדי לדעתהיכן תהיה ההפגנה, מה מתוכנן במהלכה, מי יגיע אליה, כמה אנשים יהיו נוכחים ואילו צמתים עלולים להיחסם. בין היתר הוחדרה הרוגלה גם לניידים של ראשי מחאת "הנכים הופכים לפנתרים", קבוצת נכים שפועלת מאז 2017 למען השוואת קצבאות הנכות לגובה שכר המינימום וכן בטלפונים של מארגני ההפגנות של יוצאי אתיופיה בישראל שמחו נגד יחסה של המשטרה כלפיהם.
law.co.il מזכיר שהיועץ המשפטי היוצא לממשלה מינה צוות לבדיקת השימוש בפגסוס במשטרה. בראשות הצוות עומדת המשנה ליועמ"ש, עו"ד עמית מררי, וחברים בו שני בכירים בשב"כ לשעבר. עם זה, לנוכח היקפי השימוש המתגלים בתחקירי כלכליסט, law.co.il סבור שיש למנות מיד ועדת חקירה חיצונית בראשות שופט בדימוס.